支付佣金和手续费如何进行税务处理

甲股份有限公司为高新技术企业，经营范围：计算机系统服务；数据处理；监控防盗系统、车辆调度系统软件产品的开发与销售。2014年度，发生与支付佣金和手续费相关事项如下：

1、经有关部门核准，通过增发1000万股本公司普通股，每股面值1元，每股市价25元。为增发该部分股份，甲公司支付会计审计费、律师费80万元，向证券承销机构支付200万元佣金和手续费，均取得合法票据，全部计入“管理费用”科目。

2、2014年2月，与境外机构签订代理服务协议，从境外购入两台电子设备，计81.70万美元，折合人民币500万元。甲公司按合同价的8%支付境外机构佣金6.54万美元，折合人民币40万元，并按规定代扣代缴相关税费，佣金支出计入销售费用。该电子设备于2014年3月投入使用，预计净残值率5%，预计使用年限3年，按年限平均法计提折旧，计入当期成本费用金额118.75万元（年末无在产品和产成品）。

3、与境内乙代理中介服务企业订立合同。合同约定：乙企业为甲公司介绍购买软件客户，并促成购销双方成交。当乙公司代理服务数量达到1000套时，以每套40元结算手续费；当代理数量超过1000套时，其超过部分以每套70元结算手续费。甲、乙双方确认的2014年手续费结算表反映，全年代理服务软件2800套，应付手续费=1000×40+1800×70=16.60万元。乙公司开具合法票据，通过银行转账方式结算。

甲公司2014年企业所得税汇算清缴中，对上述事项未纳税调整。

审计人员认为甲公司税务处理不恰当。依据《财政部、国家税务总局关于企业手续费及佣金支出税前扣除政策的通知》（财税[2009]29号）规定，企业发生与生产经营有关的手续费及佣金支出，除保险企业外的其他企业，按与具有合法经营资格中介服务机构或个人（不含交易双方及其雇员、代理人和代表人等）所签订服务协议或合同确认的收入金额的5%计算限额。文件明确，企业为发行权益性证券支付给证券承销机构的手续费及佣金不得税前扣除。已计入固定资产、无形资产等相关资产的手续费及佣金支出，应当通过折旧、摊销等方式分期扣除，不得在发生当期直接扣除。

1、甲公司为发行权益性证券支付给证券承销机构佣金和手续费，其会计处理应冲减“资本公积-股本溢价”，而不能在管理费用中列支，应纳税调增。审计人员还发现，该公司股票溢价计入“资本公积”部分未申报缴纳印花税=[1000×(25-1)-200]×0.05%=11.90万元，应补申报，并纳税调减。净调增金额=200-11.90=188.10万元。

2、按规定，甲公司支付境外佣金计入固定资产成本金额=500×5%=25万元，电子设备的计税成本=500+25=525万元。应提折旧=525×（1-5%）÷36×9=124.69万元。实际计提折旧118.75万元，应纳税调增金额=（118.75+40）-124.69=34.06万元。

3、审计人员核实，乙公司全年代理服务软件数量正确，甲公司向购买方开具发票软件的含税单价均为1000元。可税前扣除手续费=2800×1000×5%=14万元。实际支付金额16.60万元，应纳税调增金额=16.6-14.40=2.60万元。

综上所述，甲公司发生的与佣金及手续费相关事项，应纳税调增金额=188.10+34.06+2.60=224.76万元。

甲公司对审计意见无异议。